2014年南京最好的感染科医院排行，主要是由同行专家投票来判定。涵盖医学会感染科临床专科的全国主任委员、副主任委员以及中青年委员会的主任委员、副主任委员，2014年还将中国医师协会的“常委及正副会长”纳入到评审专家库，数据更大，更客观。参与评审的同行专家在综合考虑全市各家医院的学科建设、临床技术与医疗质量、科研水平等因素进行排名。
盘点2014年南京最好的感染科医院，江苏省人民医院排名第一，医院感染病科是我国高校首批硕士学位授予点，江苏省最早的内科学传染病专业博士学位授予点和SFDA批准的药物临床试验机构抗感染专业，也是传染病专科医师进修基地，并承担以本科生和研究生教学为主的多层次高等医学教学任务，被评为江苏省临床医学重点学科、江苏省“兴卫工程”的感染病学重点学科等，其中病毒性肝炎的治疗为其主要发展方向；南京大学医学院附属鼓楼医院排名第二，医院感染病科承担南京大学医学院和南京医科大学教学工作，并为南京大学、和南京中医药大学博士及硕士学位培养点，对于不明原因发热的诊断和治疗、难治性、复杂性感染的诊治以及抗生素的合理应用、病毒性肝炎等肝病的诊治等形成自身特色；解放军南京454医院排名第三，医院感染科主治范围为各类病毒性肝炎、肝硬化、脂肪肝、急性慢性肝病，各类自身性免疫肝病，各种肠道、呼吸道等传染病，原为全国空军重点科室，曾经承担过全军、军区空军和省级科研课题13项；排名第四和第五的分别为东南大学附属中大医院和南京市第二医院。
2014年南京最好的感染科医院排名如下，数据来源于前瞻指南研究院医疗产业数据库。
