2014年重庆最好的感染科医院排行，主要是由同行专家投票来判定。涵盖医学会口腔科临床专科的全国主任委员、副主任委员以及中青年委员会的主任委员、副主任委员，2014年还将中国医师协会的“常委及正副会长”纳入到评审专家库，数据更大，更客观。参与评审的同行专家在综合考虑全市各家医院的学科建设、临床技术与医疗质量、科研水平等因素进行排名。
盘点2014年重庆最好的感染科医院，第三军医大学西南医院排名第一，医院感染科专科医院是第三军医大学惟一的传染科及传染病学教研室，也是全国综合性医院中规模最大的传染科之一，现为5个传染病学国家重点学科之一，同时也是全军感染病研究所、重庆市肝病研究所、重庆市感染病研究重点实验室、国家药品食品监督管理局（SFDA）认证的国家临床药理（GCP）基地，主要特长为慢性乙、丙型肝炎的诊断和治疗，尤其是肝衰竭/重型肝炎的诊断与临床救治水平居国内领先；重庆医科大学附属第二医院排名第二，医院感染科是国家级重点学科，博士学位授予点和博士后流动站，系全国肝炎药物临床药理基地，重庆市肝病治疗研究中心核心科室，擅长对各种病因所致的慢性肝炎（包括乙型、丙型肝炎）、重症肝炎的诊治，除抗病毒治疗外，还针对不同个体，采用独特有效的生物、免疫治疗并举的治疗方法，对病毒、细菌、寄生虫、酒精、药物、毒素所致的肝炎、肝坏死、肝纤维化、肝硬化、肝癌的防治，很有特色，治疗肝炎新药临床研究与评价处于国内领先水平；重庆医科大学附属第一医院排名第三，医院感染病科是首批国家重点学科、卫生部首批抗感染和寄生虫药物临床药理研究基地、西部地区首批传染病与寄生虫病研究所，在感染性疾病诊治、重症感染救治、抗菌药物合理应用、细菌耐药性研究以及寄生虫病诊断和治疗等方面处于国内领先水平；排名第四和第五的分别为重庆三峡中心医院和重庆开县人民医院。
2014年重庆最好的感染科医院排名如下，数据来源于前瞻指南研究院医疗产业数据库。
