故事围绕一只年轻的秘鲁小熊展开。这只喜欢吃柠檬酱的小熊（本·威士肖 配音）从暗无天日的秘鲁抵达伦敦，在伦敦的的帕丁顿站迷路了，它呆在失物招领处外，坐在一只被压扁行李箱上，大衣上挂着一个牌子：“请照顾这只熊。谢谢。”于是遇到了一个人类家庭并与他们朝夕相处，因为小熊的秘鲁名字没人能明白，所以善良的人类家庭就根据车站的名字给这只小熊起名叫帕丁顿，他见到的每个人都对其喜爱有加。 但是，只有米莉森特（妮可·基德曼 饰）除外，她是一个恶毒的博物馆长，一心只想着把这个可爱的小家伙制成标本关进她的博物馆里……