圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物，7位Master和7位Servant为了得到圣杯而相互厮杀的仪式被称为圣杯战争。第五次圣杯战争中最关键的人物——间桐樱，父亲时臣为不浪费她的魔术回路将她过继给间桐家。她被间桐脏砚植入了数百的刻印虫，忍受着从肉体到精神上的巨大痛苦。 对间桐樱所隐瞒的状况一无所知的卫宫士郎和间桐樱终于确定了恋爱的关系，然而间桐樱却依然要忍受体内的腐蚀以及间桐慎二残忍的虐待；另一方面，间桐樱的姐姐远坂凛却展现着她在方方面面超越樱的优秀，甚至对卫宫士郎的态度也逐渐暧昧，在这基础之上，间桐樱的自卑与痛苦终于变成了仇恨，孕育在魔力源之中的恶魔瞬间控制了她的内心。